שורש שן הוא הבסיס המחזיק את השן בלסת. שן שעברה טיפול שורש, אינה מכילה רקמת מוך הכוללת כלי דם ועצבים המזינים את השן, אלא חומר אשר הוחדר במהלך הטיפול הקודם.
ישנם מצבים שיש צורך בטיפול בתעלות אחרי טיפול שורש, אך בגלל בעיות שונות, אין אפשרות לחזור על טיפול השורש ולכן ניתן לנקוט בטיפול בתעלות השורש המתבצע בצורה כירורגית (אפיסקטומי) בעזרת מיקרוסקופ דנטלי טיפולי.
רופא מומחה לטיפולי שורש (אנדודונט) יבצע ניתוח מיקרוסקופי שמאפשר לפתור את הבעיה ללא צורך בעקירת השן.
טיפול זה המתבצע ע"י רופא מומחה לטיפולי שורש (אנדודונט) מאפשר לטפל בשיניים בהן הגישה לתעלות השורש חסומה, או בשיניים בהן רוצים לשמור על שקום קיים (כתר או גשר) בלי לפגוע בו ולחסוך עלויות לא מבוטלות.
במצבים מסויימים, בעיקר כשקיימת בעיית דלקת, נוטים המטופלים לפנות לכירורג אשר יטפל בבעיה "מהשורש" או על ידי עקירה. לעומת זאת, טיפול שורש כירורגי (אפיסקטומי) המבוצע ע"י רופא מומחה לטיפולי שורש (אנדודונט) בעזרת מיקרוסקופ, מאפשר לבצע ניקוי של תעלות השורש ואיטום שלהן ולכן אחוזי הריפוי של טיפול זה גבוהים לעין ארוך ונעים סביב 90%.